É possível editar seu save de Pokemon X, Y, Omega Ruby, Alpha Sapphire, Sun, Moon, Ultra Sun ou Ultra Moon diretamente do 3DS.
O software se chama PKSM e o github com download do instalador .CIA pode ser encontrado aqui.
Cuidado ao editar a natureza (nature) dos pokemons, pois talvez o software não altere o personality value, podendo banir você do jogo. Aparentemente mudar IVs não traz esse tipo de problema.
Referências
Can you get banned for using powersaves…?
https://gamefaqs.gamespot.com/boards/696959-pokemon-x/71097810
Personality value
https://bulbapedia.bulbagarden.net/wiki/Personality_value